Skip isi

Tes genetik sing disederhanakake kanggo kabeh jinis EB

Cara sing luwih murah lan luwih cepet kanggo ngurutake gen EB bisa tegese diagnosis sing luwih awal, menehi kulawarga luwih ngerti babagan pengaruh penyakit lan akses menyang dhukungan sing cocog.

Dr-Ene-Choo-Tan

Dr Ene-Choo Tan kerja ing rumah sakit ing Singapura ing ngendi 12-15 wong sing duwe gejala EB, sawise idin kanggo tes genetik, bakal menehi sampel getih cilik. Proyek iki bakal ngurutake gen sing dikenal melu EB nggunakake cara sing beda kanggo ngenali lan nambah cara sing paling apik kanggo entuk asil sing akurat kanthi cepet.

Waca liyane ing blog peneliti kita.

Kredit gambar: National Human Genome Research Institute (NHGRI).

 

Babagan pendanaan kita

 

Pimpinan Riset Dr Ene-Choo Tan
Lembaga KK Women's & Children's Hospital, Singapura
Jinis EB Kabeh jinis EB
Keterlibatan pasien 12-15 wong sing bakal diuji sacara genetis kanggo EB
Jumlah pendanaan £10,500
Dawane proyek taun 1
Tanggal wiwitan 1 Maret 2024
ID internal DEBRA GR000044

 

Rincian proyek

Peneliti wis lelungan menyang macem-macem negara Asia Tenggara kanggo nggarap dokter lokal babagan diagnosis lan manajemen pasien EB. Dheweke nggunakake teknologi urutan sing luwih anyar sing wis suwe diwaca kanggo nemokake owah-owahan genetik sing ora kejawab dening teknologi urutan sing diwaca cekak sing lawas.

Peneliti Utama: Dr Tan dilatih minangka ahli genetika molekuler, kanthi gelar Master of Science saka Universitas Wisconsin - Madison lan PhD saka Institut Biologi Molekuler lan Sel.

Rekan peneliti: Dr Koh minangka dokter kulit pediatrik kanthi minat khusus babagan kelainan kulit genetik, kalebu EB. Dheweke mbantu nyiyapake DEBRA Singapura lan kerep kolaborasi karo dokter kulit pediatrik liyane saka sak wilayah kanggo ngatur pasien EB.

"Sanajan sawetara kasus bisa didiagnosis sacara klinis, presentasi sing tumpang tindih lan sing gegandhengan karo umur ndadekake tantangan kanggo nggawe diagnosis akurat saka jinis tartamtu. Entuk diagnosis genetik ing EB bakal ngaktifake diagnosis akurat saka subtipe spesifik, sing penting kanggo prognosis jangka panjang lan manajemen gejala sing cocog.… Identifikasi mutasi genetik uga penting kanggo tes prenatal ing kasus sing abot lan tes biologis famili. sederek, lan nuntun keputusan babagan KB."

- Dr. Tan

Judhul Grant: Ngapikake diagnosis genetik epidermolisis bullosa kanthi urutan sing dawa diwaca.

Epidermolysis Bullosa (EB) minangka kondisi langka sing ditondoi dening kerapuhan kulit, sing nyebabake lepuh lan erosi ing trauma cilik. Ing jinis EB tartamtu, parut bisa kedadeyan sekunder amarga lepuh lan erosi. Kajaba saka kulit, EB uga bisa mengaruhi permukaan mukosa sing dilapisi epitelium, kayata tutuk, esofagus, saluran pencernaan, saluran kemih, lan mata. Parut ing jaringan kasebut bisa kedadeyan, nyebabake komplikasi luwih lanjut kayata striktur. EB uga bisa nyebabake komplikasi liyane kayata anemia, pertumbuhan sing ora apik, lan masalah ortopedi, uga nambah risiko kanker kulit tartamtu, kayata karsinoma sel skuamosa. Kabeh papat jinis utama EB (EB simplex, junctional EB, dystrophic EB, lan sindrom Kindler) disebabake kelainan genetik.

Amarga EB sacara klinis heterogen kanthi spektrum keruwetan lan presentasi sing tumpang tindih, bisa uga angel mbedakake antarane jinis utama, uga luwih saka 30 subtipe klinis, utamane ing taun-taun awal urip. Konfirmasi molekuler kudu ditindakake kanggo diagnosis definitif kanggo mbantu prédhiksi asil jangka panjang lan nuntun perawatan sing cocog. Tingkat sukses nggayuh asil positif liwat tes genetik kisaran saka 50-90% kanggo cara saiki single-gene Sanger utawa multi-gene short-read sequencing. Urutan sing diwaca dawa durung digunakake sacara ekstensif kanggo nyelidiki pirang-pirang gen EB. Teknologi Nanopore sing wis suwe diwaca bisa ngurutake fragmen DNA sing dawa kanggo ngidini urutan gen sing luwih lengkap bisa ngasilake asil sing luwih apik kanggo nemokake mutasi genetik sing ndasari, nyedhiyakake diagnosis sing luwih akurat.

Fitur klinis saka macem-macem jinis EB bisa tumpang tindih lan asring nyebabake dilema diagnostik ing awal urip. Tes genetik awal lan akurat bisa nyebabake diagnosis cepet saka subtipe EB, nyedhiyakake ramalan sing luwih apik lan manajemen sing luwih apik uga kanggo ngantisipasi lan ngawasi komplikasi.

Saiki, pangujian genetik yaiku kanthi urutan simultan saka pirang-pirang gen utawa exome (wilayah genome sing ngemot gen), sing biasane ngurutake fragmen sing cendhak. Urutan nanopore saka fragmen sing luwih dawa (kalebu wilayah non-coding) bisa nyebabake asil diagnostik sing luwih dhuwur lan nemokake luwih akeh varian genetik. Entuk asil genetis sing positif penting kanggo pasien. Ing kasus pediatrik sing abot, penting kanggo nutupi wong tuwa lan mbantu meteng ing mangsa ngarep. Ngenali varian genetik ing proband uga ngidini pambiji risiko kanggo kulawarga lengkap. Informasi babagan cacat genetis uga bisa digunakake kanggo testing operator kanggo wangun resesif saka EB ngendi loro alel risak dipun warisaken saka loro tuwane sing saben nggawa salinan risak. Pengujian genetik uga bisa ditindakake kanggo ngenali mutasi spontan kanggo wangun dominan EB kanggo tes pranatal utawa pra-implantasi.

Kanggo luwih ngerti kursus penyakit klinis sing ndasari gejala EB, kita butuh luwih akeh varian genetik sing bisa diidentifikasi ing pirang-pirang pasien supaya bisa nggayutake data genetik kanthi presentasi penyakit. Nemokake luwih akeh varian genetis uga bakal nyebabake pangerten sing luwih apik babagan proses molekuler sajrone patogenesis penyakit, sing bisa nyebabake pangembangan agen farmakologis anyar lan perawatan liyane.

Aku minangka ahli genetika kanthi minat kanggo nemokake dhasar penyakit kanthi sabab genetik. Co-investigatorku yaiku ahli dermatologi kanthi minat khusus ing EB. Dheweke wis aktif ing komunitas EB lokal lan uga ing wilayah kasebut, lelungan menyang negara Asia Tenggara liyane kanggo nggarap dokter lokal babagan diagnosis lan manajemen pasien EB. Kita wis nggunakake urutan genetik kanggo ngenali kelainan molekular saka kelainan genetik. Urutan generasi sabanjure nggunakake teknologi maca cekak (kayata platform Illumina lan Ion) saiki wis mantep lan wis dadi standar perawatan ing praktik klinis nanging duwe watesan ing sawetara kelainan genetik sing bisa diidentifikasi. Kita nggarap teknologi urutan sing wis suwe diwaca sing luwih anyar kanggo muga-muga bisa nemokake kelainan genetik sing ora kejawab dening urutan sing diwaca cekak, sing kalebu penghapusan, sisipan, lan duplikasi sing luwih gedhe.